การจัดหมวดหมู่และการใช้งานเฉพาะของกล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสงระดับมืออาชีพ
มีวิธีการจำแนกประเภทต่างๆ สำหรับกล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสง โดยสามารถแบ่งออกเป็นกล้องจุลทรรศน์แบบสองตาและตาข้างเดียวตามจำนวนช่องมองภาพที่ใช้ ขึ้นอยู่กับว่าภาพมีความรู้สึกสามมิติหรือไม่ ก็สามารถแบ่งออกเป็นการมองเห็นแบบสเตอริโอและกล้องจุลทรรศน์การมองเห็นที่ไม่ใช่แบบสเตอริโอ ตามวัตถุสังเกตการณ์สามารถแบ่งออกเป็นกล้องจุลทรรศน์ชีวภาพและโลหะวิทยา ฯลฯ ตามหลักการทางแสง มันสามารถแบ่งออกเป็นโพลาไรซ์ คอนทราสต์เฟส และกล้องจุลทรรศน์คอนทราสต์การรบกวนที่แตกต่างกัน ตามประเภทของแหล่งกำเนิดแสง มันสามารถแบ่งออกเป็นแสงธรรมดา แสงฟลูออเรสเซนต์ แสงอินฟราเรด และกล้องจุลทรรศน์เลเซอร์ ฯลฯ ตามประเภทของเครื่องรับ มันสามารถแบ่งออกเป็นกล้องจุลทรรศน์ภาพ ภาพถ่าย และโทรทัศน์ กล้องจุลทรรศน์ที่ใช้กันทั่วไป ได้แก่ กล้องจุลทรรศน์สเตอริโอแบบสองตา, กล้องจุลทรรศน์โลหะ, กล้องจุลทรรศน์โพลาไรซ์, กล้องจุลทรรศน์เรืองแสงอัลตราไวโอเลต ฯลฯ
กล้องจุลทรรศน์สเตอริโอแบบสองตาใช้เส้นทางแสงแบบสองช่องสัญญาณเพื่อสร้างภาพสามมิติสำหรับดวงตาทั้งซ้ายและขวา โดยพื้นฐานแล้วมันคือกล้องจุลทรรศน์หลอดเดียวสองตัวที่วางเรียงกัน โดยมีแกนแสงของหลอดทั้งสองสร้างมุมมองที่เทียบเท่ากับมุมมองที่เกิดขึ้นเมื่อสังเกตวัตถุด้วยตาทั้งสองข้าง จึงเป็นการสร้างภาพสามมิติสามมิติ- กล้องจุลทรรศน์สเตอริโอแบบสองตาถูกนำมาใช้กันอย่างแพร่หลายในสาขาชีววิทยาและการแพทย์สำหรับการผ่าตัดแบ่งส่วนและการผ่าตัดด้วยกล้องจุลทรรศน์ ใช้ในอุตสาหกรรมสำหรับการสังเกต การประกอบ ตรวจสอบ และงานอื่น ๆ ของส่วนประกอบขนาดเล็กและวงจรรวม
กล้องจุลทรรศน์ทางโลหะวิทยาเป็นกล้องจุลทรรศน์เฉพาะทางที่ใช้ในการสังเกตโครงสร้างทางโลหะวิทยาของวัตถุทึบแสง เช่น โลหะและแร่ธาตุ วัตถุทึบแสงเหล่านี้ไม่สามารถสังเกตได้ด้วยกล้องจุลทรรศน์แบบส่องผ่านแสงแบบธรรมดา ดังนั้นความแตกต่างที่สำคัญระหว่างทองคำและกล้องจุลทรรศน์แบบธรรมดาก็คือ วัตถุแบบแรกจะส่องสว่างด้วยแสงสะท้อน ในขณะที่วัตถุแบบหลังจะส่องสว่างด้วยแสงที่ส่องผ่าน ในกล้องจุลทรรศน์โลหะวิทยา ลำแสงส่องสว่างจะถูกส่งจากเลนส์ใกล้วัตถุไปยังพื้นผิวของวัตถุที่สังเกต ซึ่งสะท้อนจากพื้นผิวของวัตถุ จากนั้นจึงกลับไปยังเลนส์ใกล้วัตถุเพื่อทำการถ่ายภาพ วิธีการสะท้อนแสงนี้ยังใช้กันอย่างแพร่หลายในการตรวจจับเวเฟอร์ซิลิคอนวงจรรวม
กล้องจุลทรรศน์ยูวีฟลูออเรสเซนซ์เป็นกล้องจุลทรรศน์ที่ใช้แสงอัลตราไวโอเลตเพื่อกระตุ้นการเรืองแสงเพื่อการสังเกต ตัวอย่างบางส่วนอาจไม่แสดงรายละเอียดเชิงโครงสร้างในแสงที่มองเห็นได้ แต่หลังจากการย้อมสี พวกมันสามารถเปล่งแสงที่มองเห็นได้เนื่องจากการเรืองแสงเมื่อฉายรังสีด้วยแสงอัลตราไวโอเลต ทำให้เกิดภาพที่มองเห็นได้ กล้องจุลทรรศน์ประเภทนี้มักใช้ในด้านชีววิทยาและการแพทย์
กล้องจุลทรรศน์โทรทัศน์และกล้องจุลทรรศน์คู่ชาร์จเป็นกล้องจุลทรรศน์ที่ใช้เป้าหมายของกล้องโทรทัศน์หรืออุปกรณ์ชาร์จคู่เป็นองค์ประกอบรับ ติดตั้งเป้าหมายของกล้องโทรทัศน์หรืออุปกรณ์ชาร์จคู่ที่พื้นผิวภาพจริงของกล้องจุลทรรศน์เพื่อแทนที่ดวงตามนุษย์เป็นตัวรับสัญญาณ อุปกรณ์ออปโตอิเล็กทรอนิกส์เหล่านี้จะแปลงภาพออพติคอลให้เป็นภาพสัญญาณไฟฟ้า จากนั้นจึงทำการตรวจจับขนาด การนับอนุภาค และงานอื่นๆ กับอุปกรณ์เหล่านั้น กล้องจุลทรรศน์ประเภทนี้สามารถใช้ร่วมกับคอมพิวเตอร์ได้ ซึ่งอำนวยความสะดวกในการตรวจจับและการประมวลผลข้อมูลอัตโนมัติ และมักใช้ในสถานการณ์ที่ต้องใช้การตรวจจับที่น่าเบื่อจำนวนมาก
