วิธีการนับโดยตรงสำหรับจุลินทรีย์โดยใช้กล้องจุลทรรศน์
การใช้เครื่องวัดเม็ดเลือดเพื่อนับจุลินทรีย์โดยตรงภายใต้กล้องจุลทรรศน์เป็นวิธีการที่ใช้กันทั่วไปในการนับจุลินทรีย์ ข้อดีของวิธีนี้คือสัญชาตญาณและความเร็ว วางสารแขวนลอยแบคทีเรียที่เจือจางอย่างเหมาะสม (หรือสารแขวนลอยสปอร์) ในห้องนับระหว่างสไลด์ของฮีโมไซโตมิเตอร์และฝาครอบสไลด์ และนับจำนวนภายใต้กล้องจุลทรรศน์ เนื่องจากปริมาตรคงที่ของห้องนับ (0.1 มม.2) จำนวนจุลินทรีย์ทั้งหมดต่อหน่วยปริมาตรจึงสามารถแปลงได้ตามจำนวนจุลินทรีย์ที่สังเกตได้ภายใต้กล้องจุลทรรศน์ เนื่องจากวิธีนี้จะคำนวณผลรวมของเซลล์แบคทีเรียที่มีชีวิตและเซลล์ที่ตายแล้ว จึงเรียกอีกอย่างว่าวิธีการนับจำนวนแบคทีเรียทั้งหมด
แผ่นนับเม็ดเลือดมักเป็นสไลด์แก้วที่ออกแบบมาเป็นพิเศษซึ่งมีร่องสี่ช่องที่ประกอบเป็นสามแท่น แท่นตรงกลางถูกแบ่งครึ่งด้วยร่องแนวนอนสั้นๆ และแต่ละด้านของแท่นจะถูกแกะสลักด้วยตาราง แต่ละตารางจะแบ่งออกเป็นสี่เหลี่ยมขนาดใหญ่เก้าช่อง และสี่เหลี่ยมขนาดใหญ่ตรงกลางคือห้องนับจำนวนที่ใช้สำหรับการนับจำนวนจุลินทรีย์ โครงสร้างของแผ่นนับเม็ดเลือดแสดงในรูปที่ VIII-1
โดยทั่วไปมีข้อกำหนดสองประการสำหรับขนาดของห้องนับ ประการแรกคือสี่เหลี่ยมจัตุรัสขนาดใหญ่แบ่งออกเป็นสี่เหลี่ยมจัตุรัสกลาง 16 ช่อง และแต่ละจัตุรัสกลางจะถูกแบ่งออกเป็นสี่เหลี่ยมจัตุรัสเล็ก ๆ อีก 25 ช่อง (รูปที่ VIII -2) อีกวิธีหนึ่งคือการแบ่งสี่เหลี่ยมจัตุรัสขนาดใหญ่ออกเป็นสี่เหลี่ยมจัตุรัสกลาง 25 ช่อง และแต่ละจัตุรัสกลางจะแบ่งออกเป็นสี่เหลี่ยมจัตุรัสเล็กอีก 16 ช่อง (รูปที่ VIII -1, C) แต่ไม่ว่ากระดานนับจะมีขนาดเท่าใดก็ตาม จำนวนสี่เหลี่ยมเล็กในแต่ละสี่เหลี่ยมใหญ่จะเท่ากัน นั่นคือ 16 × 25=400 สี่เหลี่ยมเล็ก ดังแสดงในรูปที่ VIII-2
ถ้าความยาวด้านของสี่เหลี่ยมใหญ่แต่ละอันคือ 1 มม. พื้นที่ของสี่เหลี่ยมใหญ่แต่ละอันจะเท่ากับ 1 มม. 2 หลังจากหุ้มด้วยกระจกครอบแล้ว ความสูงระหว่างสไลด์และกระจกครอบคือ 0.1 มม. ดังนั้นปริมาตรของห้องนับคือ 0.1 มม.3
เมื่อทำการนับ โดยปกติจะนับจำนวนแบคทีเรียทั้งหมดในห้าช่องสี่เหลี่ยม จากนั้นจึงได้ค่าเฉลี่ยของแต่ละช่องสี่เหลี่ยม การคูณด้วย 16 หรือ 25 จะได้จำนวนแบคทีเรียทั้งหมดในช่องสี่เหลี่ยมขนาดใหญ่ จากนั้นจึงแปลงเป็นจำนวนแบคทีเรียทั้งหมดในสารละลายแบคทีเรีย 1 มิลลิลิตร






