เมื่อเลือกว่าจะใช้หรือซื้อระบบใด ข้อพิจารณาประการแรกคือพารามิเตอร์ใดที่สำคัญที่สุดสำหรับการทดลอง ได้แก่ ความเร็ว ความไว ความละเอียด การเลือกปฏิบัติหลายความยาวคลื่น หรือความมีชีวิตของเซลล์ ซึ่งหลายพารามิเตอร์ขัดแย้งกันเองและต้องการ ที่จะถูกบุกรุก ข้อพิจารณาประการที่สองคือวัตถุประสงค์ของการใช้ระบบนี้มีไว้สำหรับการตรวจจับเฉพาะบางอย่าง หรือเพื่อการตรวจจับทั่วไป โดยทั่วไปแล้ว ระบบที่มีความยืดหยุ่นในการเลือกฮาร์ดแวร์จะเหมาะสมกว่าสำหรับการตรวจสอบเฉพาะ แต่มีข้อกำหนดทางเทคนิคสูงกว่าสำหรับการประกอบและการใช้งาน การเลือกระบบที่มีซอฟต์แวร์สำเร็จรูปจะช่วยประหยัดเวลา ไม่ว่าคุณจะเลือกระบบประเภทใด ให้ทดสอบกับวัสดุทดลองของคุณเองก่อน ตัวแทนขายของบริษัทต้องเลือกฟิลเตอร์ แหล่งกำเนิดแสงกระตุ้น และเลนส์ใกล้วัตถุที่เหมาะสมตามสีย้อมเรืองแสงที่ใช้ในการทดลองและกำลังขยายที่ต้องการเมื่อสาธิตอุปกรณ์ นอกจากวัสดุชีวภาพที่น่าสนใจแล้ว ควรใช้ชุดสไลด์ที่มีสีย้อมต่างกันเพื่อเปรียบเทียบระบบต่างๆ ตามข้อมูลเชิงปริมาณที่ได้รับ
กล้องจุลทรรศน์
สิ่งแรกที่ต้องทำคือเลือกระหว่างกล้องจุลทรรศน์แบบตั้งตรง (มองจากด้านบน) หรือแบบกลับด้าน (มองจากด้านล่าง) โดยทั่วไปแล้ว กล้องจุลทรรศน์กลับหัวมีประโยชน์เมื่อสังเกตเซลล์ที่มีชีวิตและได้ภาพ 3 มิติที่มีความละเอียดสูง ขั้นตอนของกล้องจุลทรรศน์แบบกลับด้านช่วยให้ผู้ทดลองจัดการตัวอย่างได้ง่ายขึ้น อำนวยความสะดวกในการฉีดไมโคร และอำนวยความสะดวกในการใช้ตู้อบที่ควบคุมสิ่งแวดล้อม ในขณะเดียวกัน กล้องจุลทรรศน์แบบกลับด้านยังให้เสถียรภาพเชิงกลที่ดีขึ้นสำหรับการติดตั้งกล้อง CCD
การเลือกเลนส์ใกล้วัตถุ
การเลือกเลนส์ใกล้วัตถุและโหมดการใช้งานเป็นตัวแปรสำคัญที่ส่งผลต่อคุณภาพของภาพ การเลือกวัตถุประสงค์ของกล้องจุลทรรศน์ที่เหมาะสมสำหรับสื่อการติดตั้งเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการถ่ายภาพ วัตถุประสงค์ของกล้องจุลทรรศน์สามารถทำงานได้ในอากาศ (โดยปกติจะมีกำลังขยายต่ำ) การแช่น้ำ (WI) หรือสารละลายกลีเซอรอล (ร้อยละ 80) น้ำมันซิลิโคน หรือน้ำมันสำหรับวัตถุประสงค์ทั่วไป (RI 1.50 ถึง 1.534) เลนส์ใกล้วัตถุเป็นส่วนที่สำคัญที่สุดในกล้องจุลทรรศน์ และต้องได้รับการตรวจสอบและทำความสะอาดเป็นประจำ
