วิธีการตรวจหาจุลินทรีย์ที่ใช้กันทั่วไปหลายวิธี
1. วิธีการเพาะเชื้อแบบจานวุ้น เนื่องจากอาหารเลี้ยงเชื้อที่แตกต่างกัน วิธีการเพลตวุ้นจึงแบ่งออกเป็นวิธีการตรวจจับตัวกลางแบบเลือกสรรและวิธีการตรวจจับตัวกลางโครโมจีนิก อาหารเลี้ยงเชื้อแบบคัดเลือกคือการเติมสารยับยั้งแบบเลือกสรรให้กับอาหารเลี้ยงเชื้อเพื่อยับยั้งการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ที่ไม่ใช่เป้าหมาย อาหารเลี้ยงเชื้อโครโมเจนิกคือการเติมสารตั้งต้นโครโมเจนิกสำหรับเอนไซม์จำเพาะของแบคทีเรียลงในอาหารเลี้ยงเชื้อเพื่อแยกแยะโคโลนีเป้าหมายจากโคโลนีที่ไม่ใช่เป้าหมายด้วยสีโคโลนี อาณานิคม
2. การตรวจด้วยกล้องจุลทรรศน์ หลังจากที่จุลินทรีย์ในตัวอย่างที่จะทดสอบได้รับการเสริมสมรรถนะแล้ว จุลินทรีย์เหล่านั้นจะถูกนับโดยตรงภายใต้กล้องจุลทรรศน์น้ำมัน โดยทั่วไปวิธีการจุลทรรศน์จะใช้ร่วมกับวิธีการเพาะเลี้ยงแบบจานวุ้น อาณานิคมของแบคทีเรียได้รับการวิเคราะห์ในเชิงคุณภาพโดยวิธีการเพาะเลี้ยงแบบแผ่นวุ้น จากนั้นจึงนับเชิงปริมาณโดยใช้กล้องจุลทรรศน์ แม้ว่าวิธีการทดสอบแบบเดิมไม่จำเป็นต้องใช้อุปกรณ์สูงและมีเนื้อหาทางเทคนิคต่ำ แต่ก็ใช้เวลานานและใช้แรงงานมาก ห้องปฏิบัติการทดสอบทั่วไปสามารถเลือกวิธีทดสอบตามสภาวะจริงได้อย่างสมเหตุสมผล โดยไม่จำกัดเพียงรูปแบบของการเลือกวิธี
3. เทคโนโลยีการตรวจจับชิ้นทดสอบจุลินทรีย์ โดยทั่วไป แถบทดสอบจุลินทรีย์จะประกอบด้วยฟิล์มโพลีโพรพีลีนที่พิมพ์ด้วยตาราง และฟิล์มโพลีเอทิลีนที่เคลือบด้วยอาหารเลี้ยงเชื้อและสารพัฒนาสี หลังจากผ่านกระบวนการแล้ว ตัวอย่างที่จะทดสอบสามารถนำไปเพาะเชื้อบนชิ้นทดสอบจุลินทรีย์ได้โดยตรง จากนั้นนำไปวางที่อุณหภูมิที่เหมาะสมสำหรับการเพาะปลูก เพื่อให้สารพัฒนาสีที่ติดอยู่บนชิ้นทดสอบทำปฏิกิริยากับเอนไซม์จำเพาะที่เกิดจากการเจริญเติบโตของ จุลินทรีย์ที่จะทดสอบทำให้เกิดปฏิกิริยาโครโมจินิก อาณานิคมที่มีสีสามารถตรวจพบได้โดยการนับอาณานิคมเหล่านี้






