ขั้นตอนการทํางานของส่วนดิจิตอลของกล้องจุลทรรศน์ดิจิตอล:
1. ติดตั้ง Motic Lmages Plus 2.0 ML ลงในคอมพิวเตอร์ และสามารถใช้กล้องจุลทรรศน์ดิจิตอลได้ตามปกติ
2. ดึงคันโยกบนหัวกล้องจุลทรรศน์ดิจิตอลออกไปยังตําแหน่งสุดท้ายของ Z ในเวลานี้กล้องจุลทรรศน์อยู่ในสถานะที่ทั้งการสังเกตด้วยภาพและกล้อง CCD สามารถทําได้
3. ดับเบิลคลิกที่ไอคอน Moticimages 2000 บนเดสก์ท็อปคอมพิวเตอร์คลิกปุ่ม "อุปกรณ์" ในอินเทอร์เฟซกล้องจุลทรรศน์ดิจิตอล Motic และเลือกประเภทไดรฟ์ CCD จากเมนูแบบเลื่อนลง หลังจากยืนยันชนิดไดรฟ์แล้วจะเข้าสู่สถานะการแสดงตัวอย่างโดยอัตโนมัติ ในเวลานี้ไฟแสดงสถานะบนฝาครอบ CCD เปิดอยู่แสดงว่ากล้องจุลทรรศน์เข้าสู่สถานะการทํางานแบบดิจิตอล ภาพของส่วนที่สังเกตได้จะปรากฏในหน้าต่างดูซึ่งสอดคล้องกับที่เห็นจากกล้องจุลทรรศน์
4. สําหรับการปรับภาพที่สังเกตได้ ให้ดูขั้นตอนการทํางานของส่วนออปติคอล