ความแตกต่างระหว่างกล้องจุลทรรศน์สองโฟตอนและกล้องจุลทรรศน์คอนโฟคอลแบบเลเซอร์
กล้องจุลทรรศน์คอนโฟคอลแบบเลเซอร์คือชุดของระบบการสังเกต การวิเคราะห์ และระบบเอาท์พุตที่ใช้เลเซอร์เป็นแหล่งกำเนิดแสง หลักการและอุปกรณ์การโฟกัสแบบคอนจูเกตโดยใช้กล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสงแบบดั้งเดิม และการประมวลผลภาพดิจิทัลของวัตถุที่สังเกตได้โดยใช้คอมพิวเตอร์ ระบบหลักประกอบด้วยแหล่งกำเนิดแสงเลเซอร์ กล้องจุลทรรศน์อัตโนมัติ โมดูลการสแกน (รวมถึงช่องแสงคอนโฟคอลและรูเข็ม กระจกสแกน เครื่องตรวจจับ) ตัวประมวลผลสัญญาณดิจิทัล คอมพิวเตอร์และอุปกรณ์ส่งออกภาพ (จอภาพ เครื่องพิมพ์สี) และอื่นๆ ด้วยกล้องจุลทรรศน์คอนโฟคอลสแกนด้วยเลเซอร์ ทำให้สามารถเอกซเรย์และถ่ายภาพตัวอย่างการสังเกตได้ เป็นผลให้สามารถสังเกตและวิเคราะห์โครงสร้างเชิงพื้นที่สามมิติของเซลล์ได้โดยไม่เกิดความเสียหาย
ในเวลาเดียวกัน กล้องจุลทรรศน์คอนโฟคอลแบบสแกนด้วยเลเซอร์เป็นเครื่องมืออันทรงพลังสำหรับการสังเกตแบบไดนามิกของเซลล์ที่มีชีวิต การติดฉลากอิมมูโนฟลูออเรสเซนซ์หลายชนิด และการติดฉลากไอออนเรืองแสง ลักษณะของสเปกตรัมได้รับการวิเคราะห์อย่างแม่นยำ และสัญญาณของเครื่องหมายต่างๆ ที่มีสเปกตรัมการปล่อยก๊าซที่ทับซ้อนกันสูงจะถูกแยกแยะออกไป
สิ่งสำคัญที่สุดคือ สำหรับการย้อมสีฟลูออเรสเซนซ์หลายสี จะกำจัดผลกระทบของครอสทอล์คฟลูออเรสเซนซ์โดยสิ้นเชิง ขณะเดียวกันก็ลดการสูญเสียสัญญาณฟลูออเรสเซนซ์จากตัวอย่างให้เหลือน้อยที่สุด ทั้งหมดนี้อยู่นอกเหนือการเข้าถึงของกล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสงทั่วไป
