1. ความยากในการติดตั้ง
ติดตั้งเลนส์ใกล้ตาและเลนส์ใกล้วัตถุของกล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสงก่อนใช้งาน การติดตั้งเลนส์ใกล้ตาค่อนข้างตรงไปตรงมา อย่างไรก็ตาม ปัญหาส่วนใหญ่มักเกิดขึ้นที่เลนส์ใกล้วัตถุ เนื่องจากเลนส์ใกล้วัตถุมีราคาค่อนข้างแพง จึงเป็นเรื่องง่ายที่เลนส์จะตกลงพื้นและเป็นอันตรายต่อเลนส์หากปิดเกลียวไม่ถูกต้องเมื่อนักเรียนติดตั้ง ขอแนะนำให้นักเรียนติดตั้งเลนส์ใกล้วัตถุเมื่อทำเช่นนั้นเพื่อความปลอดภัย ถือวัตถุประสงค์ระหว่างนิ้วชี้ซ้ายและนิ้วกลางและติดตั้งด้วยมือขวาสามารถป้องกันไม่ให้ตกแม้ว่าจะติดตั้งไม่ถูกต้องก็ตาม
2. ปัญหาเรื่องแสง
การจัดแสงเป็นขั้นตอนที่สำคัญมากเมื่อใช้กล้องจุลทรรศน์ แทนที่จะใช้เลนส์กำลังขยายต่ำตามคำแนะนำเมื่อมองหาแสง นักเรียนบางคนหันเลนส์ใกล้วัตถุโดยพลการให้หันไปทางรูโปร่งใส เวลาหมุนกระจก ผมมักจะลากกระจกลงด้วยมือข้างเดียว ครูผู้สอนจึงต้องเน้นการใช้กระจกที่ใช้พลังงานต่ำเพื่อให้แสงสว่างในการฝึกอบรมนักเรียน ใช้รูรับแสงขนาดเล็กและกระจกเรียบเมื่อแสงจ้า และใช้รูรับแสงขนาดใหญ่และกระจกเว้าเมื่อแสงน้อย ใช้มือทั้งสองข้างหมุนแผ่นสะท้อนแสง สู่ขอบเขตการมองเห็นแบบวงกลมที่สว่างสม่ำเสมอ หลังจากจัดแนวแสงแล้ว ให้หลีกเลี่ยงการเคลื่อนย้ายกล้องจุลทรรศน์โดยประมาท เพื่อป้องกันแสงที่ไม่ถูกต้องเข้าไปในรูใสโดยการสะท้อนในตัวสะท้อนแสง
3. ปัญหาเกี่ยวกับการใช้งานสกรู quasi-focus อย่างถูกต้อง
ส่วนที่สำคัญและท้าทายที่สุดของการใช้กล้องจุลทรรศน์คือการสอนนักเรียนถึงวิธีใช้สกรูโฟกัสเพื่อตรวจจับภาพวัตถุและเปลี่ยนความยาวโฟกัส ในระหว่างขั้นตอน นักเรียนมักจะทำข้อผิดพลาดต่อไปนี้:
การปรับโฟกัสโดยตรงด้วยเลนส์ขยายที่แข็งแกร่ง
ข. ดวงตาจะจับโฟกัสที่ระยะการมองเห็นในช่องมองภาพเสมอ ไม่ว่ากระบอกเลนส์จะยกขึ้นหรือลง
ค. ยังไม่ชัดเจนว่าค่าวิกฤติของระยะวัตถุเป็นอย่างไร มันยังคงเพิ่มขึ้นและสกรูกึ่งโฟกัสกำลังหมุนอย่างรวดเร็วเมื่อตั้งระยะห่างของวัตถุไว้ที่ 2-3 ซม.
เมื่อนักเรียนใช้กล้องจุลทรรศน์ ข้อผิดพลาดที่สามคือข้อผิดพลาดที่เกิดขึ้นบ่อยที่สุด เนื่องจากข้อผิดพลาดสองประเภทแรกมักส่งผลให้เลนส์ใกล้วัตถุรบกวนเมาท์และทำให้เมาท์หรือเลนส์เสียหาย
4. ปัญหาเกี่ยวกับการแปลงเลนส์ใกล้วัตถุ
ใช้เลนส์กำลังขยายสูงหลังจากใช้เลนส์กำลังขยายต่ำ เนื่องจากวัสดุของตัวแปลงมีความอ่อนนุ่มและมีความเที่ยงตรงสูง นักเรียนจึงมักชอบใช้นิ้วผลักและหมุนเลนส์ใกล้วัตถุ เพราะคิดว่าวิธีนี้จะช่วยประหยัดเวลาได้ อย่างไรก็ตาม เนื่องจากเกลียวสามารถคลายออกได้ง่ายด้วยแรงที่ไม่สม่ำเสมอ แกนออพติคอลของเลนส์ใกล้วัตถุจึงบิดเบี้ยวได้ง่าย ตัวแปลงทั้งหมดจะถูกโยนออกหากเธรดแตก ควรสอนให้นักเรียนจับจานหมุนด้านล่างของคอนเวอร์เตอร์ขณะแปลงเลนส์ใกล้วัตถุ
5. ปัญหาการใช้สายตาอย่างถูกวิธี
ควรเปิดตาทั้งสองข้างพร้อมกันเมื่อใช้กล้องจุลทรรศน์ และตาซ้ายควรหันไปทางเลนส์ใกล้ตา แต่นักเรียนจำนวนมากมักจะทำสิ่งนี้ไม่สำเร็จ พวกเขามักจะปิดตาขวาหรือเอามือปิดตา ซึ่งขัดกับข้อกำหนดในการสังเกตการณ์ของการทดลอง เพื่อดูและร่าง ครูควรสาธิตให้จับต้องได้ในขณะที่ชี้ประเด็นปัญหาของนักเรียน สอนนักเรียนให้ตาซ้ายอยู่ใกล้เลนส์ตามากที่สุด และพยายามจ้องเข้าไปในลานสายตาด้วยตาขวา การปฏิบัติเช่นนี้ซ้ำๆ จะส่งผลให้ต้องเปิดตาทั้งสองข้างพร้อมกันเพื่อการสังเกต
